Daňová kontrola

Sdílet na:
Daňová kontrola
Daňová kontrola představuje klíčový nástroj správce daně pro ověření správnosti daňových povinností poplatníků. V článku se dozvíte, jaký je její průběh, jaká máte práva a povinnosti a co může následovat po jejím ukončení.

Účel a význam daňové kontroly

Daňová kontrola je nástrojem správy daní, jehož cílem je ověřit správnost, úplnost a pravdivost údajů uváděných daňovými subjekty v daňových přiznáních, hlášeních a dalších podáních. Provádí ji příslušný správce daně, zpravidla finanční úřad, a to buď v sídle daňového subjektu, nebo v prostorách správce daně. Provádění daňové kontroly se řídí zákonem č. 280/2009 Sb., daňový řád.

Box illustration

Daňová kontrola se může týkat fyzických i právnických osob. Nejčastěji je zahajována u subjektů s podezřelými transakcemi, výraznými odchylkami v účetnictví nebo na základě podnětů zvenčí (např. od jiných orgánů nebo bývalých zaměstnanců).

Příprava na daňovou kontrolu

Dle § 86 daňového řádu mezi povinnosti podnikatele při zahájení kontroly patří: 

  • zajištění vhodného místa a podmínek k provádění daňové kontroly,

  • poskytnutí informací – o vlastní organizační struktuře, o pracovní náplni jednotlivých útvarů, o oprávněních vašich zaměstnanců nebo jiných osob a o uložení účetních záznamů,

  • předložení důkazních prostředků,

  • umožnit jednání s kterýmkoliv vašim zaměstnancem nebo jinou osobou, která vykonává jeho činnost,

  • nezatajovat důkazní prostředky.

Průběh daňové kontroly krok za krokem

1. Oznámení o zahájení

Daňová kontrola je zahájena doručením oznámení o zahájení kontroly. Může mít podobu osobního předání, doručení do datové schránky nebo doporučeného dopisu.

2. Zahájení a vedení kontroly

Správce daně si vyžádá příslušné účetní doklady, evidence nebo smlouvy. V průběhu kontroly mohou být prováděny výslechy, místní šetření a porovnávání údajů. Subjekt má právo být přítomen u všech úkonů.

Box illustration

Dobrá komunikace a spolupráce se správcem daně výrazně snižují riziko doměrků a sankcí.

3. Ukončení kontroly

Po provedení všech úkonů správce daně vyhotoví návrh protokolu, se kterým se daňový subjekt může seznámit a do 15 dnů se k němu vyjádřit. Po uplynutí této lhůty vydá správce daně protokol o kontrole, který je závazným dokumentem.

Podnikatel má možnost:

  • podat námitky proti protokolu,

  • v případě neshody vést odvolací řízení,

  • přiznat a uhradit případný nedoplatek daně bez dalšího sporu.

Práva a povinnosti daňového subjektu

Daňový subjekt má právo:

  • být přítomen u všech úkonů

  • nahlížet do spisu

  • navrhovat důkazy

  • podat vyjádření k návrhu protokolu

Má také povinnost:

  • umožnit přístup ke všem požadovaným dokumentům

  • poskytovat součinnost

  • zajistit přítomnost odpovědných osob

Box illustration

Udržujte přehledné a aktuální účetnictví a archivujte dokumenty alespoň po dobu 10 let. Urychlíte tím průběh kontroly.

Důkazní břemeno

Důkazní břemeno při daňové kontrole nese primárně podnikatel – musí být schopen doložit všechna svá tvrzení uvedená v daňovém přiznání prostřednictvím důkazních prostředků, jako jsou účetní doklady, smlouvy, znalecké posudky nebo výslechy svědků. Správce daně však také nese důkazní břemeno, pokud zpochybňuje správnost údajů – musí konkrétně prokázat, v čem spočívají pochybení, a to často na základě informací poskytnutých podnikatelem během kontroly.

Závěr

Daňová kontrola je standardním nástrojem finanční správy k ověření daňových povinností podnikatelů. Odpovědný přístup, dobrá příprava a spolupráce s úřady výrazně snižují rizika sankcí. Podnikatelé by měli své účetnictví udržovat v pořádku průběžně – nejen při hrozbě kontroly.

S námi zvládne
fakturovat úplně každý
Vystavit fakturu
Faktura

Související články

Daně v ČR: přehled všech druhů a aktuální sazby
2. 11. 2026

V Česku aktuálně existuje sedm hlavních daní – čtyři přímé a tři nepřímé. Některé se týkají prakticky každého podnikatele, jiné jen úzké skupiny. V tomto přehledu najdete všechny druhy daní, jejich aktuální sazby, koho se týkají a co se mění od roku 2027.

Silniční daň a kniha jízd: Co musí podnikatel vědět
2. 11. 2026

Silniční daň se od roku 2022 výrazně zjednodušila – osobní auta a dodávky jsou od ní osvobozeny. Od roku 2026 ale platí upravené sazby a zrušená sleva pro kombinovanou dopravu s vodní cestou, což se dotkne hlavně dopravců s těžkými nákladními vozidly. A pokud k podnikání používáte auto, pravděpodobně musíte vést knihu jízd. Přinášíme přehled aktuálních pravidel, termínů a praktických tipů.

Slevy na dani: Kompletní průvodce daňovými slevami pro podnikatele a zaměstnance
2. 11. 2026

Daňové slevy snižují daň zaměstnancům i podnikatelům. Přinášíme přehled slev pro rok 2027 včetně obnoveného školkovného a slevy na studenta, jejich výši a postup, jak je uplatnit.

Energetická daň
2. 11. 2026

Energetická daň, někdy označovaná i jako ekologická daň, patří mezi nepřímé daně, které platí konečný spotřebitel. Stejně jako DPH nebo spotřební daň je zahrnuta v ceně výrobku, a tak zůstává pro běžného občana často neviditelná. Jejím cílem je kompenzovat negativní dopady spotřeby energetických produktů na životní prostředí, zejména ve formě emisí skleníkových plynů.